Puerto Baquerizo Moreno es la ciudad capital de Galápagos y el centro administrativo del Parque Nacional Galápagos. Con sólo 6.000 habitantes, el pueblo tiene un ambiente relajado que es un buen cambio si viene de Puerto Ayora. Las excursiones y cruceros salen desde este puerto. Hay varias playas y senderos a poca distancia caminando desde el centro del pueblo, algunos senderos ofrecen a los viajeros observatorios para disfrutar de la vista hermosa del archipiélago.

Justo a las afueras de Puerto Baquerizo Moreno está el aeropuerto de la isla. Volar hacia Santa Cruz y salir de San Cristóbal, o viceversa, también es una opción para los viajeros que están en un itinerario muy apretado. Desde el 2014, el aeropuerto de San Cristóbal se encuentra actualmente en construcción. Sin embargo, todavía se pueden reservar vuelos hacia o desde el aeropuerto, aunque las instalaciones y servicios son limitados.

La Lobería es un tramo de costa rocosa a las afueras de Puerto Baquerizo Moreno. Este sitio ofrece buena oportunidad para observar una gran colonia de lobos marinos y aves. Otro lugar ideal para ver a estos animales se encuentra en Isla de los Lobos, que es un paseo de 30 minutos en barco desde Puerto Baquerizo Moreno.

León Dormido es una formación de roca masiva que se extiende verticalmente fuera del mar y está absolutamente lleno de vida silvestre. A lo largo de las paredes de los acantilados, hay varias especies de aves que se pueden ver anidando, incluyendo las fragatas y piqueros de patas azules. Debajo de la superficie, vemos los peces loro, tortugas marinas, mantarayas y tiburones que son los visitantes frecuentes de León Dormido. Los que practiquen esnórkel o buceo, pueden pasar a través de uno de los canales estrechos de la isla o a lo largo de las paredes. Este sitio es visitado habitualmente en excursiones de un día. Se trata de un viaje en barco corto de 1 hora desde Puerto Baquerizo Moreno a León Dormido.